11.5 将 Conda 包作为依赖项发布给项目
NOTE : 此示例代码可以在 https://github.com/dev-cafe/cmake-cookbook/tree/v1.0/chapter-11/recipe-05 中找到。该示例在 CMake 3.5 版(或更高版本) 中是有效的,并且已经在 GNU/Linux、macOS 和 Windows 上进行过测试。
这个示例中,我们将基于之前示例的结果,并且为 CMake 项目准备一个更真实和复杂的 Conda 包,这将取决于 DGEMM 的函数实现,对于矩阵与矩阵的乘法,可以使用 Intel 的 MKL 库进行。Intel 的 MKL 库可以以 Conda 包的形式提供。此示例将为我们提供一个工具集,用于准备和共享具有依赖关系的 Conda 包。
准备工作
对于这个示例,我们将使用与前一个示例中的 Conda 配置,和相同的文件命名和目录结构:
. ├── CMakeLists.txt ├── conda-recipe │ └── meta.yaml └── example.cpp
示例文件( example.cpp
) 将执行矩阵-矩阵乘法,并将 MKL 库返回的结果与“noddy”实现进行比较:
#include "mkl.h" #include <cassert> #include <cmath> #include <iostream> #include <random> int main() { // generate a uniform distribution of real number between -1.0 and 1.0 std::random_device rd; std::mt19937 mt(rd()); std:: uniform_real_distribution < double > dist(-1.0, 1.0); int m = 500; int k = 1000; int n = 2000; double *A = (double *)mkl_malloc(m * k * sizeof(double), 64); double *B = (double *)mkl_malloc(k * n * sizeof(double), 64); double *C = (double *)mkl_malloc(m * n * sizeof(double), 64); double * D = new double[m * n]; for (int i = 0; i < (m * k); i++) { A[i] = dist(mt); } for (int i = 0; i < (k * n); i++) { B[i] = dist(mt); } for (int i = 0; i < (m * n); i++) { C[i] = 0.0; } double alpha = 1.0; double beta = 0.0; cblas_dgemm(CblasRowMajor, CblasNoTrans, CblasNoTrans, m, n, k, alpha, A, k, B, n, beta, C, n); // D_mn = A_mk B_kn for (int r = 0; r < m; r++) { for (int c = 0; c < n; c++) { D[r * n + c] = 0.0; for (int i = 0; i < k; i++) { D[r * n + c] += A[r * k + i] * B[i * n + c]; } } } // compare the two matrices double r = 0.0; for (int i = 0; i < (m * n); i++) { r += std::pow(C[i] - D[i], 2.0); } assert (r < 1.0e-12 & & "ERROR: matrices C and D do not match"); mkl_free(A); mkl_free(B); mkl_free(C); delete[] D; std:: cout << "MKL DGEMM example worked!" << std:: endl; return 0;` }
我们还需要修改 meta.yaml
。然而,与上一个示例相比,唯一的变化是在依赖项中加入了 mkl-devel
:
package: name: conda-example-dgemm version: "0.0.0" source: path: ../ # this can be changed to git-url build: number: 0 script: - cmake -H. -Bbuild_conda -G "${CMAKE_GENERATOR}" -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${PREFIX} # [not win] - cmake -H. -Bbuild_conda -G "%CMAKE_GENERATOR%" -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="%LIBRARY_PREFIX%" # [win] - cmake - -build build_conda - -target install requirements: build: - cmake >=3.5 - {{ compiler('cxx') }} host: - mkl - devel 2018 about: home: http://www.example.com license: MIT summary: "Summary in here ..."
具体实施
CMakeLists.txt
文件声明了最低版本、项目名称和支持的语言:cmake_minimum_required(VERSION 3.5 FATAL_ERROR) project(recipe-05 LANGUAGES CXX) set(CMAKE_CXX_STANDARD 11) set(CMAKE_CXX_EXTENSIONS OFF) set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
- 使用
example.cpp
构建dgem-example
可执行目标:add_executable(dgemm-example "") target_sources(dgemm-example PRIVATE example.cpp )
- 然后,需要找到通过
MKL-devel
安装的 MKL 库。我们准备了一个名为IntelMKL
的INTERFACE
库,该库可以用于其他目标,并将为依赖的目标设置包括目录、编译器选项和链接库。根据 Intel 的建议( https://software.intel.com/en-us/articles/intel-mml-link-line-advisor/ ) 进行设置。首先,设置编译器选项:add_library(IntelMKL INTERFACE) target_compile_options(IntelMKL INTERFACE $<$<OR:$<CXX_COMPILER_ID:GNU>,$<CXX_COMPILER_ID:AppleClang>>:-m64> )
- 接下来,查找
mkl.h
头文件,并为IntelMKL
目标设置include
目录:find_path(_mkl_h NAMES mkl.h HINTS ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/include ) target_include_directories(IntelMKL INTERFACE ${_mkl_h} ) message(STATUS "MKL header file FOUND: ${_mkl_h}")
- 最后,为
IntelMKL
目标设置链接库:find_library(_mkl_libs NAMES mkl_rt HINTS ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/lib ) message(STATUS "MKL single dynamic library FOUND: ${_mkl_libs}") find_package(Threads QUIET) target_link_libraries(IntelMKL INTERFACE ${_mkl_libs} $<$<OR:$<CXX_COMPILER_ID:GNU>,$<CXX_COMPILER_ID:AppleClang>>:Threads::Threads> $<$<OR:$<CXX_COMPILER_ID:GNU>,$<CXX_COMPILER_ID:AppleClang>>:m> )
- 使用
cmake_print_properties
函数,打印IntelMKL
目标的信息:include(CMakePrintHelpers) cmake_print_properties( TARGETS IntelMKL PROPERTIES INTERFACE_COMPILE_OPTIONS INTERFACE_INCLUDE_DIRECTORIES INTERFACE_LINK_LIBRARIES )
- 将这些库连接到
dgem-example
:target_link_libraries(dgemm-example PRIVATE IntelMKL )
CMakeLists.txt
中定义了安装目标:install( TARGETS dgemm-example DESTINATION bin )
- 尝试构建包:
$ conda build conda-recipe
- 过程中屏幕上将看到大量输出,但是一旦构建完成,就可以对包进行安装包。首先,在本地进行安装测试:
$ conda install --use-local conda-example-dgemm
- 现在测试安装,打开一个新的终端(假设 Anaconda 处于激活状态),并输入:
$ dgemm-example MKL DGEMM example worked!
- 安装成功之后,再进行卸载:
$ conda remove conda-example-dgemm
工作原理
meta.yaml
中的变化就是 mml-devel
依赖项。从 CMake 的角度来看,这里的挑战是定位 Anaconda 安装的 MKL 库。幸运的是,我们知道它位于 ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}
中。可以使用在线的 Intel MKL link line advisor
( https://software.intel.com/en-us/articles/intel-mml-link-line-advisor/ ) 查看如何根据选择的平台和编译器,将 MKL 链接到我们的项目中,我们会将此信息封装到 INTERFACE
库中。这个解决方案非常适合类 MKL 的情况:库不是由我们的项目或任何子项目创建的目标,但是它仍然需要以一种方式进行处理;也就是:设置编译器标志,包括目录和链接库。 INTERFACE
库是构建系统中的目标,但不创建任何构建输出(至少不会直接创建)。但由于它们是目标,我们可对它们的属性进行设置。这样与“实际”目标一样,可以安装、导出和导入。
首先,我们用 INTERFACE
属性声明一个名为 IntelMKL
的新库。然后,根据需要设置属性,并使用 INTERFACE
属性在目标上调用适当的 CMake 命令:
- target_compile_options:用于设置
INTERFACE_COMPILE_OPTIONS
。示例中,设置了-m64
,不过这个标志只有 GNU 和 AppleClange 编译器能够识别。并且,我们使用生成器表达式来实现。 - target_include_directories:用于设置
INTERFACE_INCLUDE_DIRECTORIES
。使用find_path
,可以在找到系统上的mkl.h
头文件后设置这些参数。 - target_link_libraries:用于设置
INTERFACE_LINK_LIBRARIES
。我们决定链接动态库libmkl_rt.so
,并用find_library
搜索它。GNU 或 AppleClang 编译器还需要将可执行文件链接到线程和数学库。同样,这些情况可以使用生成器表达式优雅地进行处理。
在 IntelMKL
目标上设置的属性后,可以通过 cmake_print_properties
命令将属性进行打印。最后,链接到 IntelMKL
目标,这将设置编译器标志,包括目录和链接库:
target_link_libraries(dgemm-example PRIVATE IntelMKL )
更多信息
Anaconda 云上包含大量包。使用上述方法,可以为 CMake 项目构建依赖于其他 Conda 包的 Conda 包。这样,就可以探索软件功能的各种可能性,并与他人分享您的软件包!
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